Ash capturó a su Cyndaquil en el episodio Buena Caza de 'Quil (ES) / La Cacería de Cyndaquil (HA)‹№› en un bosque famoso por estar poblado de muchos Cyndaquil. Ash fue separado de sus amigos y perseguido por el Team/Equipo Rocket en una cueva donde se encontró a este Pokémon. Después de derrotar al Team/Equipo Rocket, un entrenador que también quería un Cyndaquil reta a Ash a una batalla en la cual él acepta. Cyndaquil logra derrotar al Sandslash del oponente permitiendole a Ash conservarlo. Aunque al principio Cyndaquil no podía controlar su llama a voluntad, siempre tenía que calentar antes de atacar.
Después en Combates ardientes (ES) / Duelos ardientes (HA)‹№› Cyndaquil tiene un entrenamiento especial con Ash para poder encender sus llamas facilmente después de haber sido derrotado por el Skarmory de Miki. Durante el entrenamiento, no solo consigue dominar su fuego, sino que también gana fuerza y velocidad, la cual le es de ayuda para derrotar al Skarmory de Miki en su revancha.
En la batalla contra Jasmine/Yasmina en Nervios de Steelix (ES), (HA)‹№›, Cyndaquil venció su Steelix a pesar de que este dio una buena batalla al bloquear su ataque de lanzallamas y golpearlo consecutivamente con su excavar y cola férrea. Pero Cyndaquil utilizo los agujeros creados por Steelix en su beneficio al esconderse en estos y encenderlos todos al mismo tiempo con su lanzallamas.
Cyndaquil reaparece en ¡Reencuentro con viejos amigos! (ES) / ¡Una vieja mezcla de familia! (HA)‹№› cuando Ash lo llama junto a otro de sus Pokémon del laboratorio del Profesor Oak para convivir un rato con ellos. Sin embargo, la Pokéball de Cyndaquil, junto con las de sus otros Pokémon se pierden cuando el Team/Equipo Rocket intentó robarlas. Una vez que Ash encontró a Cyndaquil, este estaba siendo atacado por el Team/Equipo Rocket. Cuando el robot del Team/Equipo Rocket intentó atraparlo, Cyndaquil evolucionó a Quilava, otorgándole la fuerza suficiente para derrotar al Team/Equipo Rocket con su recién aprendido estallido.
Cuando era un Cyndaquil tenía que calentar para encender sus llamas pero el de Dawn/Maya (actualmente Quilava), a pesar de ser un bebé las puede controlar perfectamente.
Es el Pokémon de Ash que más ha tardado en evolucionar, 507 episodios en total.
Es el único inicial de fuego que captura que no había sido abandonado antes.
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